在海南土白蚁的巢区结构中，比黑翅土白蚁的蚁道系统要简单得多：无大型主蚁道（黑翅土白蚁的主蚁道的底径有时在10cm以上），道形变化不大，支蚁道很微小，蚁道间的细络体系很不完善，这是因为该种白蚁的群体中的白蚁个体较少，同时个体小的缘故。

　　一般海南土白蚁有1~2条主蚁道，直穿主巢（王宫）的底部，并多数是垂直大坝的中轴线。主蚁道小分叉，大都是沿着主蚁道的方向上，分出数条微小的支蚁道，小的支蚁道上连接着一些小菌圃。小支蚁道的大小多以底径计，以只能容纳1~2只白蚁通行的孔道为限。主蚁道的大小可以达到3.5cm×2.0cm（底径×高），甚至更大。一般的主蚁道都是底平上拱的扁月形状，从近地面到主巢（王宫）和穿越王宫的主蚁道，道形的变化很小，基本上是扁月形状，根本不像黑翅土白蚁的道形是由扁到高，越接近主巢道形越高的演变。

　　从分飞孔追挖主巢（王宫）的距离范围是在0.5~8.1m之间，绝大多数是在4m之内，少数巢例超过5m从泥被、泥线追挖到主巢（王宫）的距离范围是在0.6~4.0m之内，说明海南土白蚁从主巢出到地面上取食的路程比较短的原因是主巢在地下分布浅。