低等白蚁的消化系统排列方式无明显差异。前肠中的嗦囊基本上是对称的，比较长的中肠总是以一种正常的方式终止。马氏管着生在中肠与后肠的分界处。潮州白蚁防治中心提示低等白蚁除少数种类外，均有8根马氏管。后肠5节明显，无混合节。低等白蚁常见的肠道结构很像与其有密切亲缘关系的蟑螂的肠道结构。低等白蚁的前胃较发达，有助于研碎食物，前胃常有几丁化的体刺；中肠较长并通常具有中肠盲囊，用来吸收被酶类降解的液体；后肠较小并具有后肠盲囊,后肠盲囊内均有鞭毛虫共生。这种类型的肠道，代表了一般的食碎屑习性和后肠发酵系统的组合。在后肠盲囊的无氧环境中，鞭毛虫将部分消化的食物进行发酵。